Nagli pad populacije malog vranca zabilježen je sredinom 20. stoljeća u cijeloj jugoistočnoj Europi, zbog čega je dobio status kritično ugrožene vrste. Uzrok ugroženosti vezan je uz močvarna staništa koja su uništena melioracijskim radovima,  što je u kombinaciji s kanaliziranjem rijeka i  nestajanjem šaranskih ribnjaka  ekstenzivnog uzgoja pogodovalo drastičnom smanjenju brojnosti populacije ove vrste. Mali vranac je postao rijedak stanovnik naših područja sve do kraja devedesetih godina, kada je ponovno zabilježeno gniježđenje nekoliko parova u parku prirode Kopački rit. Iako na prostoru naše županije  nije zabilježeno gniježđenje, mali vranac se ipak  može  vidjeti tijekom zime duž velikih rijeka gdje ga je u blizini grada Iloka zabilježio Mario Raguž, djelatnik Javne ustanove za upravljanje zaštićenim prirodnim vrijednostima Vukovarsko-srijemske županije. Mali vranac pripada po odredbi Zakona o zaštiti prirode strogo zaštićenim životinjskim vrstama, te je prema Pravilniku o visini naknade štete za usmrćivanje ove vrste određena novčana kazna u visini od 40.000,00 kuna.